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第1回CMSI神戸ハンズオン:FMO 講習会

作者: admin — 最終変更 2015年07月10日 14時59分
日時 2013年02月07日
13時00分 から 18時00分 まで
場所 CMSI神戸分室(理化学研究所・計算科学研究機構・5階501号室)
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フラグメント分子軌道(FMO)法による量子化学計算に興味がある方で、FMO法の初心者を対象としたFMO講習会を開催します。FMO法の概念と計算法についての説明とGAMESS(アイオワ州立大学・M.S.Gordon教授グループで開発されている分子軌道法計算プログラム:http://www.msg.ameslab.gov/gamess/)を用いた小さなタンパク質の計算実習を行います。

 

【開催要項】

日時: 平成25年2月7日(木) 13:00 - 18:00
場所: CMSI神戸分室(理化学研究所・計算科学研究機構・5階501号室)
受講人数: 8名(先着順)
講師: 北浦和夫(神戸大学)、Dmitri G. Fedorov(産業技術総合研究所)

 

【プログラム内容】

13:00-14:00  FMO法の基礎と応用例
14:00-15:00  GAMESSについて(FMO法の実装と使い方)
(休憩)
15:10-17:00  入力データの作成と計算実習
17:00-18:00  計算結果の可視化と質疑応答

 

【事前準備】

計算実習は64コアを持つワークステーションで行います。計算実習のためにネットワークに接続できる(有線のみ可で、無線は使えませんのでご注意ください)Windowsノートパソコンを持参してください。また、持参いただくノートパソコンには、端末ソフト(PuTTYなど)とファイル転送ソフト(WinSCPなど)をインストールしておいて下さい。さらに、FMO計算の結果を可視化するために分子モデリングソフトFacioをインストールしておいてください。PuTTY、WinSCP、Facioはフリーソフトウェアで、下記のURLからダウンロードできます。

PuTTY... http://yebisuya.dip.jp/Software/PuTTY/
WinSCP...http://sourceforge.jp/projects/winscp/
Facio... http://www1.bbiq.jp/zzzfelis/Facio_Jp.html

 

【資料(当日使用したテキスト)】

※ 以下をご参照下さい。

<開催済ハンズオン資料一覧>


【参加登録申し込み・旅費申請】

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【お問い合わせ】

計算物質科学イニシアティブ事務局 (神戸拠点)  
〒650-0047 神戸市中央区港島南町7-1-26 R501
独立行政法人理化学研究所 計算科学研究機構内
東京大学 物性研究所 計算物質科学研究センター 神戸分室
Tel: 078-940-5681
Fax: 078-304-0170
E-mail: adm-kobe@cms-initiative.jp