"A Novel Approach of Dynamic Cross Correlation Analysis on Molecular Dynamics Simulations and Its Application to Ets1 Dimer-DNA Complex"
作者: 下敷領 恵美
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2015年01月09日 14時22分
Kota Kasahara, Ikuo Fukuda, Haruki Nakamura, PLoS ONE 9(11):e112419
タンパク質の運動の解析に広く用いられる動的相関係数(DCC)は、原子の平均位置からの変位がガウス分布であることを仮定するため、タンパク質が機能する際の大変形をうまく扱えない。これに対し、Kasaharaらの開発した多モード動的相関係数(mDCC)は複数のガウス分布の重ねあわせを想定し、機能発現に本質的に重要な、残基間の相関を割り出すことに成功した。この手法は、生体分子以外の動的相関現象を抽出するのにも広く応用できる。
http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0112419
（CMSI週刊ニュースvol.37(12.26.2014)に掲載）
