大規模MD並列化の技術１
作者: admin
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2014年09月30日 13時57分
2014年前期に行われたCMSI計算科学技術特論Bの講義「第10回 大規模MD並列化の技術１」の紹介をしています。
(注) ビデオ画像の開始位置は、回線状況によりずれが生じる可能性があります。その場合は再読み込みを行ってください。
1. 分子動力学法
- 基礎方程式 ( P.4, ビデオ画像)
- 原子間相互作用 ( P.7, ビデオ画像)
- 分子内相互作用 ( P.9, ビデオ画像)
- LJ相互作用のカットオフ ( P.11, ビデオ画像)
- Coulomb相互作用 ( P.13, ビデオ画像)
2. 分子動力学計算の並列化特性
- MD計算の処理フロー ( P.18, ビデオ画像)
- プロセス分割 ( P.20, ビデオ画像)
- 通信パターン①(隣接） ( P.29, ビデオ画像)
- 通信パターン②(隣接・近接） ( P.32, ビデオ画像)
- 通信パターン③(隣接） ( P.44, ビデオ画像)
- 通信パターン④(全ノード間・総和型） ( P.47, ビデオ画像)
3. 並列化技術１ データ構造
- MPI並列化技術: データ構造 ( P.50, ビデオ画像)
- データ構造 [1]座標 ( P.51, ビデオ画像)
- データ構造 [2]多極子 ( P.60, ビデオ画像)
- まとめ ( P.70, ビデオ画像)
